iTunes Store (tidligere iTunes Music Store) er en onlinebutik, som åbnede 28. april 2003. iTunes Store tillader brugeren at købe musik og overføre den til sin iPhone, computer eller iPod. iPod'en er den eneste digitale musikafspiller, der er bygget til at fungere med iTunes Store (bortset fra enkelte Motorola-telefoner) selvom nogle ældre digitale musikafspillere også vil virke med iTunes. Apple er med trusler om bødestraf under juridisk pres, bl.a. af EU-kommissionen, for at udbrede anvendeligheden.
iTunes Store havde oprindeligt omkring 200.000 filer tilgængelige til download. Butikken åbnede i USA efter at Apple underskrev aftaler med de fem store pladeselskaber, EMI, Universal Music Group, Warner Music Group, Sony Music Entertainment, og BMG (De seneste to blev dog senere fusioneret). Musik udgivet af mere end 600 uafhængige kunstnere blev senere tilføjet – den første blev Moby den 29. juli 2003. I februar 2007 blev der indgået aftaler mellem Apple og Apple (The Beatles' pladeselskab) efter en lang strid om rettigheder til navnet. Herefter vil Beatles-kataloget blive tilgængeligt for iTunes-kunder.
Butikken har lige nu mere end 5.000.000 sange tilgængelige til download, inklusive numre fra mere end 20 kunstnere, bl.a. The Killers, Bob Dylan, U2, Eminem og Sting. Brugeren kan overføre sangene til et ubegrænset antal iPod og brænde CD'er med numrene op til 7 gange.
iTunes Store åbnede 10. maj 2005 i Danmark, Norge, Sverige og Schweiz. Dog er den danske udgave af butikken begrænset i forhold til den amerikanske. I Danmark er det kun muligt at købe musik, lydbøger, film og iPod spil samt gratis adgang til et stort bibliotek af Podcasts.
iTunes Store findes i flere end 21 lande.